Análisis comparativo de técnicas moleculares para diagnóstico de virus respiratorios: rt-pcr en tiempo real vs sistema poct del hospital teodoro maldonado carbo de guayaquil.
Palabras clave:
Especificidad; sistema POCT; panel respiratorio; patógeno; reacción en cadena de la polimerasa.Resumen
En la costa ecuatoriana, los virus respiratorios provocan alrededor de 20.000 casos al año; si bien los Rhinovirus son los más prevalentes, también hay notables incidencias de otros patógenos, como el SARS-CoV-2, Influenza A, Influenza B y el Virus respiratorio sincitial. A nivel mundial, estos virus son una de las principales causas de enfermedades del sistema respiratorio; para proteger la salud pública y prevenir impactos negativos en la comunidad, es crucial comprender cómo se propagan estos virus, así como establecer medidas preventivas y su modo de transmisión.
Las técnicas de diagnóstico molecular, como la RT-qPCR y el sistema POCT, han transformado la medicina y la investigación, brindando precisión y rapidez en la detección de patógenos que afectan al sistema respiratorio, ambos métodos fundamentados en la PCR, permiten una identificación y gestión eficaz de casos virales en contextos clínicos y epidemiológicos.
Entre abril y junio de 2023, en el Hospital de Especialidades Teodoro Maldonado Carbo, se analizaron muestras nasofaríngeas de 60 pacientes, indagando la presencia de agentes infecciosos como el SARS-COV-2, Influenza A, Influenza B y Virus sincitial respiratorio (VRS).
De los 60 pacientes analizados, los resultados para SARS-CoV-2 e Influenza B coincidieron en ambas pruebas, con un 13,33% y 1,67% de positividad, respectivamente. Para Influenza A, la RT-qPCR reportó un 10% de positividad, mientras que el sistema POCT indicó un 16,67%, en relación con el VRS, la RT-qPCR reveló un 20% de casos positivos, y el sistema POCT un 21,67%. En los análisis realizados, la RT-qPCR alcanzó una especificidad del 100%, y el sistema POCT del 85,7%. Dentro de nuestro estudio, la comparación de especificidad entre las pruebas fue esencial para determinar con precisión a aquellos individuos sanos, ya que, una elevada especificidad garantiza que los resultados negativos sean fiables y representen verdaderamente la no presencia de la enfermedad evaluada.
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Citas
Álvarez, H., & Pérez, E. (2009). Utilidad Clínica de la tabla 2x2. Revista de Evidencia e Investigación Clínica, 22-27. Obtenido de https://www.medigraphic.com/pdfs/evidencia/eo-2009/eo091c.pdf
Arandia-Guzmán J., A.-L. G. (Gac. Médica Boliv. de 2020). ARS-CoV-2: Estructura, replicación y mecanismos fisiopatológicos relacionados con COVID-19. . págs. 43:170–178.
Ballmann, E. (2021). Genotipificación del virus respiratorio sincitial tipo en muestras nasofaríngeas en pacientes pediátricos .
BioFire®. (2022). Manual BioFire® Respiratory Panel 2.1 plus. Obtenido de https://www.fda.gov/media/137583/download
Bio-Rad. (2023). Bio-Rad Laboratories, Inc. Obtenido de Bio-Rad Laboratories, Inc: https://www.bio-rad.com/
Bravo, S., & Cruz, J. (2015). Estudios de exactitud diagnóstica: Herramientas para su interpretación. Revista Chilena de Radiología, 158-164. doi:10.4067/s0717-93082015000400007
Busquets, M., Morales, C., Norte, C., & Reina, J. (2018). Utilidad del valor Ct en las infecciones respiratorias agudas causadas por el virus respiratorio sincitial A y B y los virus gripales A (H1N1)pdm09, A (H3N2) y B. Elsevier, 332-335. Obtenido de https://www.elsevier.es/es-revista-enfermedades-infecciosas-microbiologia-clinica-28-articulo-utilidad-del-valor-ct-infecciones-S0213005X17301416
Carballal, G., Marcone, D., Ricarte, C., & Echavarria. (2015). Diagnóstico de virus respiratorios utilizando un sistema automatizado de PCR múltiples (FilmArray) y su comparación con métodos convencionales. Revista Argentina de Microbiología, 29-35. doi:https://doi.org/10.1016/j.ram.2014.12.003
Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades. (2022). Tipos de virus de influenza. Centro Nacional de Vacunación y Enfermedades Respiratorias, 68-84. Obtenido de https://espanol.cdc.gov/flu/about/viruses/types.htm
Donis, J. (2012). Evaluación de la validez y confiabilidad de una prueba dianóstica. Avances en Biomedicina, 73-81. Obtenido de https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=331328015005
Duarte, L. F., Flórez, O., Rincón, G., & González, C. I. (2014). Comparación de siete pruebas diagnósticas para detectar infección por Trypanosoma cruzi en. Colombia Médica, 61-66.
Farfán. (2015). Biología Molecular Aplicada Al Diagnóstico Clínico. Rev Médica Clínica Las Condes, 788-793. doi:http://dx.doi.org/10.1016/j.rmclc.2015.11.007
Ferrari, A. M., Pirez, M. C., Ferreira, A., Rubio, I., Montano, A., Lojo, R., . . . Chiparelli, H. (2002). Estrategia de atención de niños hospitalizados por infecciones respiratorias agudas bajas. Revista De Saúde Pública, 292-300. doi:https://doi.org/10.1590/S0034-89102002000300006
Gastelo, R., Maguiña, C., & Tequen, A. (2020). El nuevo Coronavirus y la pandemia del Covid-19. Revista Medica Herediana, 125-131. doi:https://dx.doi.org/10.20453/rmh.v31i2.3776
Herrera Cartaya, C., Lage Dávila, A., Betancourt Cervantes, J., Barreto Fiu, E., & Sánchez Valdés, L. (2022). La edad como variable asociada a la gravedad en pacientes con la COVID-19. Revista Cubana de Medicina Militar, e1766. Obtenido de http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0138-65572022000100004&lng=es&tlng=es.
Marimón, J. M., & Navarro Marí, J. M. (2017). Métodos de diagnóstico rápido de las infecciones respiratorias. En Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (págs. 35(2), 108–115). https://doi.org/10.1016/j.eimc.2016.11.007.
Ministerio de Salud Pública del Ecuador. (2022). En Ecuador registra un incremento infecciones respiratorias (págs. https://www.salud.gob.ec/ecuador-registra-un-incremento-infecciones-respiratorias/#:~:text=En%20el%202022%2C%20los%20casos,COVID%2D19%20a%20esca).
Morales Angulo, C., González Zubizarreta, R., Martin Toca, G., Ramirez Bonilla, A., Gozalo Margüello, M., & Rodriguez Fernández, A. (2020). Toma de muestras nasofaríngeas para diagnóstico de COVID-19. Revista ORL, 389-394. doi:https://dx.doi.org/14201/orl.23079
Mosquera, J., Muñoz, N., Pedreáñez, A., Robalino, J., & Tene, D. (2021). El sexo como factor de riesgo de la mortalidad por COVID-19. Caso Ecuador. Kasmera, e49235672. doi:https://doi.org/10.5281/zenodo.5175260
OMS. (2019). Human Coronaviruses: A Review of Virus-Host Interactions. pág. 10.3390/diseases4030026.
OPS. (2021). La carga de las enfermedades respiratorias crónicas en la Región de las Américas. Organización Panamericana de la Salud. Obtenido de https://www.paho.org/es/enlace/carga-enfermedades-respiratorias-cronicas#:~:text=En%20la%20Regi%C3%B3n%20de%20las%20Am%C3%A9ricas%20en%20el%202019%2C%20las,50%25)%20defunciones%20en%20mujres
OPS. (18 de agosto de 2023). Organización Panamericana de la Salud. Obtenido de Organización Panamericana de la Salud.: https://www.paho.org/es/informe-situacion-influenza
Pértegas, S., & Pita, S. (2003). Pruebas diagnósticas: Sensibilidad y especificidad. Unidad de Epidemiología Clínica y Bioestadística. Complejo Hospitalario Universitario de A Coruña., 10: 120-124.
Rivera, N., Ortega, C., Sandoval, X., & Hernández, C. (2021). Muestra de saliva para diagnóstico de SARS-CoV-2 por RT-qPCR en población ambulatoria. Alerta, Revista científica Del Instituto Nacional De Salud, 38-45. doi:DOI: 10.5377/alerta.v4i2.11476
Seegene Inc. (2020). Manual Allplex™ SARS-CoV-2/FluA/FluB/RSV Assay. Seegene, 1. Obtenido de https://www.seegene.com/assays/allplex_sars_cov_2_flua_flub_rsv_assay#
Shrestha, L. (18 de Junio de 2022). Microbenotes. Obtenido de Microbenotes: https://microbenotes.com/respiratory-syncytial-virus-rsv/
Tamay de Dios, & Velasquillo. (2013). Fundamientos de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). J Invest Dermatol., 70-78.
TANBead®. (2022). Manual TANBead Nucleic Acid Extraction Kit. Obtenido de https://www.tanbead.com/en/product/page/Viral_NA_665
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